Det unike Tøihuset i Gamlebyen var ved åpningen i 1775 landets største bygning. Denne militære lagerbygningen ble plassert der byens torg og sentrum en gang lå. Mange spennende historier og liv har utspilt seg her fra 1567 og fram til i dag, og museet er stolt av å kunne bruke stedet til å fortelle byens historie.

Borgarsyssel Museum ble stiftet i 1921 og ligger ved ruinen etter St. Nikolas kirke fra omkring 1115. Museet dokumenterer og formidler Østfolds kulturhistorie fra middelalderen og fram til i dag Borgarsyssel Museum har samlinger fra store deler av Østfold, og et friluftsmuseum med et 20-talls antikvariske bygninger.

Rød Herregård er en innholdsrik kulturperle med over 300 års historie. De innflytelsesrike familiene Tank og Anker satte sitt preg på det praktfulle anlegget fra 1730-tallet til midten av 1900-tallet. Hovedhus med hage og park ligger vendt mot Iddefjorden der flotte seilskuter ankret opp i sin tid. Det vakre og godt bevarte interiøret begeistrer besøkende den dag i dag.

Moss by- og industrimuseum samler, bevarer og dokumenterer Moss bys sosiale, arkitektoniske og industrielle historie, med vekt på tidsskiftene i det 20. århundre. Moss by- og industrimuseum holder til i restaurerte lokaler i Kloster og Galla møller mellom Fossen og Lille-elv. Kloster mølle er fra 1899/1900, mens Galla mølle er fra ca. 1920.

Haldenvassdragets Kanalmuseum finner du i Ørje midt i hjertet av det naturskjønne Indre Østfold – og selvsagt rett ved Haldenvassdraget og slusene. Museet formidler kunnskap om det biologiske mangfold i skog og vassdrag. Her vises samspillet i vårt økologiske miljø og naturens usynlige hemmeligheter og områdets rike dyreliv presenteres. Med blikket rettet mot fremtiden ønsker museet å fremme vern av naturen, i all dens mangfold og sårbarhet.

Kystmuseet Hvaler er Østfoldmuseenes avdeling for kystkultur. Museet ligger på Nordgården Dypedal på Spjærøy.

Elingaard Herregård er en av landets mest helstøpte anlegg fra renessansen – en adelig setegård med røtter tilbake til middelalderen. Omkranset av bastioner og vollgraver ligger hovedbygningen fra 1749 – gjenreist på kjellerne fra 1600-tallet, og har i dag rom fra ulike epoker.

Fayegården er museet for Halden og omegns historie. Det ligger i sentrum, bak byparken, i et grønt murbygg i empirestil. Den gamle bygården er oppkalt etter handelsmannen David Faye og ble oppført i 1830. Høsten 2023 åpnet Museumskafeen og sommeren 2024 åpner museet med ferske utstillinger og aktiviteter for store og små.

I Østre kurtine på Fredriksten festning finnes Halden museum - Fredriksten hvor du kan oppleve Haldens krigshistorie og lære mer om livet på festningen.